Az organikus pamut megegyezik a pamuttal azzal a különbséggel, hogy természetes módon, növényvédő szerek, gyomirtó szerek, műtrágyák vagy egyéb vegyszerek használata nélkül termesztik.
Annak érdekében, hogy biztosan meg lehessen tudni, hogy a pamut valóban organikus-e, a termesztők külső felek általi átfogó ellátási lánc-ellenőrzésen mennek keresztül, és csak a tanúsított pamut kerül forgalmazásra. Az ökológiai gyapotfarmok száma gyorsan növekszik, azonban ez világszerte még mindig csak nagyon kis részét teszi ki a gyapottermelésnek.